Apibrėžimas peptido ryšys

Sąvoka „ nuoroda“ turi keletą naudojimo būdų: šiuo atveju mes norime paminėti jo prasmę kaip sąjungą arba ryšį tarp įvairių elementų. Kita vertus, peptidas yra susijęs su peptidais : molekulėmis, kurias sudaro kovalentinė aminorūgščių jungtis (organinės medžiagos, kurių molekulinė kompozicija turi karboksilo grupę ir amino grupę).

Peptido jungtis

Jis vadinamas peptido ryšiu su chemine jungtis, kuri yra tarp aminorūgšties karboksilo grupės ir kitos aminorūgšties amino grupės . Toks ryšys, kai prarandama vandens molekulė, leidžia sudaryti minėtus peptidus ir baltymus .

Sujungus amino grupę ( -NH2 ) ir karboksilo grupę ( -COOH ) su vandens molekulės praradimu, sukuriama CO-NH jungtis. Šiam ryšiui plėtoti visada reikia energijos ; Savo ruožtu, kai yra pažeista peptido jungtis, atsiranda energijos išleidimas.

Peptidinės jungties lūžimas gali vykti hidrolizės būdu : tai vadinama skilimu, kurį molekulė užrašo per vandenį. Hidrolizė natūralioje aplinkoje vyksta labai lėtai, nors galima paspartinti procesą įvairiais būdais .

Esant vandeniui, peptido jungtis gali būti sulūžta laisvos energijos kiekiu, kuris yra apie 8-16 kilojoules / mol (tai atitinka 2-4 kcal / mol). Kilojoule vienetą vienai molai, kurią galima simbolizuoti kaip kJ / mol, pripažįsta Tarptautinė vienetų sistema ( SI ) ir atitinka santykį tarp energijos ir medžiagos kiekio : energija išreiškiama kilodžauliais ir matuojama medžiaga. moliais

Kilojoules yra ne daugiau kaip tūkstančiai džaulų, kitas matavimo vienetas, kurį atpažįsta Tarptautinė sistema, kurios pradinis pavadinimas yra džaulis ir naudojamas šilumos, darbo ir energijos matavimui. Techniniu požiūriu, jo apibrėžimas yra „darbo, kurį atlieka Newton, pastovios jėgos palei metrą minėtos jėgos kryptimi, kiekis“. Kita vertus, molio vienetas naudojamas tam tikros medžiagos kiekiui matuoti ir yra septynių pagrindinių fizinių SI dydžių dalis.

Siekiant pagreitinti peptidinės jungties, kuri gamtoje gali užtrukti daugiau nei tūkstantmetį, hidrolizę, mokslininkai gali pasirinkti vieną iš šių būdų :

* rūgšties hidrolizė : ji pasiekiama, ilgą laiką paliekant baltymą stipriais rūgštiniais tirpalais (H2SO4 ir HCI). Šis kelias pasiekia pilną triptofano ir dalies treonino ir serino sunaikinimą;

Peptido jungtis * bazinė hidrolizė : ji paprastai atliekama naudojant BaOH arba NaOH, ir nesunaikina ankstesniame metode paminėtų aminorūgščių ;

* fermentinė hidrolizė : gyvose būtybėse toks normalus peptidinių ryšių skaidymo būdas. Tokiu atveju, proteolitiniai fermentai, kurie veikia lėtai ir dažnai nesibaigia savo darbu, tačiau nei aminorūgščių naikinimas, nei racemizacija (kai optiškai aktyvus junginys tampa raceminiu). Šis hidrolizės tipas yra labai specifinis;

* hidrolizė pagal temperatūrą : jei sąlygos yra normalios, peptidinės jungtys nėra sunaikintos, bet baltymas gali būti denatūruotas (tai yra, jos antrinės, tretinės ir ketvirtinės struktūros yra sugadintos). Kita vertus, jei temperatūra viršija 110 °, taikoma 48 val., Galima sunaikinti nuorodas.

Pažymėtina, kad apskritai peptidinė jungtis yra pavaizduota kaip viena jungtis . Bet kokiu atveju, ji turi keletą funkcijų, kurios ją priartina prie dvigubos nuorodos. Štai kodėl specialistai paprastai nurodo, kad peptidinė jungtis turi savybių, kurios ją perkelia į vieną nuorodą ir dvigubą nuorodą.

Rekomenduojama